杭州市孤儿基金会成立伊始，便着手解决孤儿的医疗援助问题。

在孤儿这个群体里，残疾儿童占到了85.8%。这些长期忍受肉体病痛和心理创伤的孤残儿童，若能及时提供手术治疗、康复训练，完全可以恢复健康；若错过最佳治疗年龄，残疾将会相伴一生，甚至还会有生命危险。

1995年5月，基金会向全社会推出了助残儿康复计划，浙医一院、浙医二院、邵逸夫医院、市一医院、解放军117医院、市整形医院、省儿童医院等7家杭城有名的大医院及专家加入此次活动。

基金会迅速与各医院确定了12个孤残儿童结对治疗计划。

患有“法洛氏四联症”的小宋南是第一个享受“康复行动”手术的孩子；患有III度左腭裂的5岁女孩小苗进行了嘴唇修复手术；先天性心脏病患儿小英术后恢复了良好的心肺功能；患有小儿麻痹症的小季在矫正手术后，可以甩掉拐杖走路了；左手并指畸形的小芳在分指手术后，能正常生活和学习……助残康复行动，让他们重回健康儿童行列。

不仅如此，基金会还深入基层福利院，帮助完善院内生活条件。1997年1月的淳安，白雪皑皑，淳安福利院内异常寒冷。当年的基金会会长陈励君、王水福、董伟平一行赶到此处，发现院内竟没有一台锅炉，孩子取暖、洗澡、蒸饭、烧水都极其不方便。回到杭州，他们立刻着手解决此事，没过多久，福利院装上了爱心锅炉，孩子们终于能有热乎乎的洗澡水了。

跟生活在儿童福利院的孩子相比，散居孤儿的生活存在着更大的变数。杭州市民政部门曾做过统计，全市散居孤儿接近300人，其中大多数是散居在各区、县（市）的农村，跟着爷爷、奶奶等亲属生活，家庭条件非常艰苦。

从2006年开始，杭州市孤儿基金会更名关爱孤儿基金会。也就在这一年，基金会将更多的精力投注到城乡散居孤儿的帮助中。帮助人数从最初的18人增加到现在的110人，一路走来，基金会不仅满足孩子们的物质需要，更着重关怀他们的精神世界。

从2010年第一届杭州市散居孤儿夏令营开始，每年一届的夏令营活动与孩子们有了一个快乐之约。有着相同遭遇的孩子们聚集在一起，在基金会工作人员的带领下，告别了自卑与孤单，互相成为了最好的朋友。

就像孤儿娟娟在夏令营结束时写下的话：“之前我觉得世界就我们村这么大，平平淡淡，毫不起眼，总是用悲观的态度去看这个世界，不是灰色就是黑色。可是我发现自己真的错了，我不要做那个忧郁的小孩，我要学着寻找生活中的乐趣，再大的痛苦也会过去，身边有很多人关心着自己，我应该感到幸福才对，我是个幸福的小孩。”